Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOM1Q5C9Z4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOM1Q5C9Z4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOM1Q5C9Z4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOM1Q5C9Z4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOM1Q5C9Z4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOM1Q5C9Z4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOM1Q5C9Z4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOM1Q5C9Z4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOM1Q5C9Z4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOM1Q5C9Z4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOM1Q5C9Z4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NOM1Q5C9Z4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NOM1Q5C9Z4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NOM1Q5C9Z4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NOM1Q5C9Z4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NOM1Q5C9Z4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NOM1Q5C9Z4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NOM1Q5C9Z4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NOM1Q5C9Z4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOM1Q5C9Z4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms