Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SBK1Q52WX2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SBK1Q52WX2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SBK1Q52WX2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms