Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL98

VMAC, Vimentin-type intermediate filament-associated coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMACQ2NL98 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VMACQ2NL98 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms