Protein–RNA interactions for Protein: Q2MV58

TCTN1, Tectonic-1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN1Q2MV58 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCTN1Q2MV58 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCTN1Q2MV58 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TCTN1Q2MV58 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCTN1Q2MV58 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TCTN1Q2MV58 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCTN1Q2MV58 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCTN1Q2MV58 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TCTN1Q2MV58 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCTN1Q2MV58 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCTN1Q2MV58 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms