Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SPRED3Q2MJR0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms