Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ISXQ2M1V0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.9 ms