Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTL8BQ17RB0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms