Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
IMPG1Q17R60 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms