Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN21Q16825 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPN21Q16825 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
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