Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYPL1Q16563 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYPL1Q16563 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYPL1Q16563 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYPL1Q16563 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYPL1Q16563 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYPL1Q16563 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYPL1Q16563 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYPL1Q16563 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
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