Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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VAMP3Q15836 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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VAMP3Q15836 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP3Q15836 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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