Protein–RNA interactions for Protein: Q15771

RAB30, Ras-related protein Rab-30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30Q15771 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAB30Q15771 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB30Q15771 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB30Q15771 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB30Q15771 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB30Q15771 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB30Q15771 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB30Q15771 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB30Q15771 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB30Q15771 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB30Q15771 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB30Q15771 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
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