Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALX1Q15699 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
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