Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRADDQ15628 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRADDQ15628 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
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