Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDSNQ15517 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
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