Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIX1Q15475 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms