Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RABEP1Q15276 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RABEP1Q15276 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
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