Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHD4Q14839 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHD4Q14839 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHD4Q14839 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHD4Q14839 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHD4Q14839 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHD4Q14839 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHD4Q14839 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHD4Q14839 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHD4Q14839 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
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CHD4Q14839 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHD4Q14839 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHD4Q14839 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHD4Q14839 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHD4Q14839 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHD4Q14839 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
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CHD4Q14839 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
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CHD4Q14839 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
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CHD4Q14839 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
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CHD4Q14839 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHD4Q14839 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHD4Q14839 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHD4Q14839 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHD4Q14839 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHD4Q14839 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
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CHD4Q14839 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHD4Q14839 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHD4Q14839 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHD4Q14839 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHD4Q14839 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHD4Q14839 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHD4Q14839 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CHD4Q14839 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHD4Q14839 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
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