Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA3AQ14563 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
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