Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBM39Q14498 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms