Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
BECN1Q14457 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
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