Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPSQ13938 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPSQ13938 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPSQ13938 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPSQ13938 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPSQ13938 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPSQ13938 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPSQ13938 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPSQ13938 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPSQ13938 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPSQ13938 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPSQ13938 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPSQ13938 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPSQ13938 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPSQ13938 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPSQ13938 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPSQ13938 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPSQ13938 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPSQ13938 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPSQ13938 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPSQ13938 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPSQ13938 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPSQ13938 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPSQ13938 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPSQ13938 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPSQ13938 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPSQ13938 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPSQ13938 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPSQ13938 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
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