Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1DQ13901 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C1DQ13901 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1DQ13901 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1DQ13901 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1DQ13901 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1DQ13901 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1DQ13901 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1DQ13901 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1DQ13901 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C1DQ13901 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1DQ13901 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1DQ13901 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1DQ13901 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1DQ13901 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1DQ13901 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1DQ13901 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1DQ13901 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1DQ13901 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1DQ13901 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1DQ13901 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1DQ13901 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1DQ13901 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1DQ13901 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1DQ13901 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1DQ13901 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1DQ13901 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1DQ13901 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1DQ13901 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1DQ13901 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1DQ13901 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1DQ13901 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1DQ13901 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1DQ13901 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1DQ13901 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C1DQ13901 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1DQ13901 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1DQ13901 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1DQ13901 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1DQ13901 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1DQ13901 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1DQ13901 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C1DQ13901 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1DQ13901 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1DQ13901 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1DQ13901 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1DQ13901 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1DQ13901 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1DQ13901 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1DQ13901 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1DQ13901 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1DQ13901 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1DQ13901 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1DQ13901 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1DQ13901 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
C1DQ13901 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1DQ13901 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1DQ13901 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1DQ13901 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1DQ13901 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1DQ13901 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1DQ13901 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1DQ13901 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1DQ13901 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1DQ13901 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1DQ13901 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1DQ13901 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1DQ13901 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1DQ13901 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1DQ13901 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1DQ13901 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1DQ13901 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C1DQ13901 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1DQ13901 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1DQ13901 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1DQ13901 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1DQ13901 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1DQ13901 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1DQ13901 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1DQ13901 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1DQ13901 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1DQ13901 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1DQ13901 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1DQ13901 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1DQ13901 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1DQ13901 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1DQ13901 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1DQ13901 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1DQ13901 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1DQ13901 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1DQ13901 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1DQ13901 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1DQ13901 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1DQ13901 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1DQ13901 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1DQ13901 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C1DQ13901 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1DQ13901 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1DQ13901 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C1DQ13901 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
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