Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2H3Q13889 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
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