Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2H2Q13888 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2H2Q13888 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2H2Q13888 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2H2Q13888 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2H2Q13888 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2H2Q13888 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2H2Q13888 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2H2Q13888 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2H2Q13888 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2H2Q13888 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2H2Q13888 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2H2Q13888 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2H2Q13888 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2H2Q13888 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2H2Q13888 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2H2Q13888 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2H2Q13888 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2H2Q13888 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2H2Q13888 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2H2Q13888 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2H2Q13888 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2H2Q13888 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2H2Q13888 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2H2Q13888 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2H2Q13888 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2H2Q13888 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H2Q13888 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
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