Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PEX6Q13608 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX6Q13608 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
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