Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMAD4Q13485 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD4Q13485 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
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