Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCGB2A2Q13296 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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SCGB2A2Q13296 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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SCGB2A2Q13296 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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SCGB2A2Q13296 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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SCGB2A2Q13296 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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SCGB2A2Q13296 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCGB2A2Q13296 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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