Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT88Q13099 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
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