Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXC1Q12948 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXC1Q12948 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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