Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 AIM10YER087W 1731 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1B-GR3Q12316 DFG5YMR238W 1377 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1B-GR3Q12316 YER186CYER186C 921 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1B-GR3Q12316 SCW4YGR279C 1161 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1B-GR3Q12316 MVD1YNR043W 1191 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1B-GR3Q12316 UBC4YBR082C 447 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1B-GR3Q12316 ARN1YHL040C 1884 nt8.27□□□□□ -1.09
TY1B-GR3Q12316 YIL177CYIL177C 5277 nt8.27□□□□□ -1.09
TY1B-GR3Q12316 SMF2YHR050W 1650 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1B-GR3Q12316 YML133CYML133C 4125 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1B-GR3Q12316 PPS1YBR276C 2424 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1B-GR3Q12316 GPI11YDR302W 660 nt8.25□□□□□ -1.09
TY1B-GR3Q12316 MRS1YIR021W 1092 nt8.25□□□□□ -1.09
TY1B-GR3Q12316 GWT1YJL091C 1473 nt8.25□□□□□ -1.09
TY1B-GR3Q12316 PYC1YGL062W 3537 nt8.25□□□□□ -1.09
TY1B-GR3Q12316 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt8.25□□□□□ -1.09
TY1B-GR3Q12316 YJL220WYJL220W 453 nt8.25□□□□□ -1.09
TY1B-GR3Q12316 DRN1YGR093W 1524 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1B-GR3Q12316 ARP3YJR065C 1350 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1B-GR3Q12316 WTM1YOR230W 1314 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1B-GR3Q12316 SCM3YDL139C 672 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1B-GR3Q12316 CTF8YHR191C 402 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1B-GR3Q12316 TAF10YDR167W 621 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1B-GR3Q12316 ARA2YMR041C 1008 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1B-GR3Q12316 MTQ1YNL063W 945 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1B-GR3Q12316 YNR040WYNR040W 771 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1B-GR3Q12316 YEH1YLL012W 1722 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1B-GR3Q12316 GFD1YMR255W 567 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1B-GR3Q12316 PRP31YGR091W 1485 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1B-GR3Q12316 AVO1YOL078W 3531 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1B-GR3Q12316 BUD8YLR353W 1812 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1B-GR3Q12316 STL1YDR536W 1710 nt8.21□□□□□ -1.09
TY1B-GR3Q12316 GDT1YBR187W 843 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1B-GR3Q12316 GEP3YOR205C 1671 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1B-GR3Q12316 VMA4YOR332W 702 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1B-GR3Q12316 ISC1YER019W 1434 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1B-GR3Q12316 ATO2YNR002C 849 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1B-GR3Q12316 DTR1YBR180W 1719 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1B-GR3Q12316 BAP2YBR068C 1830 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1B-GR3Q12316 MRPL1YDR116C 858 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1B-GR3Q12316 LCP5YER127W 1074 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1B-GR3Q12316 VAM7YGL212W 951 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1B-GR3Q12316 SLC1YDL052C 912 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1B-GR3Q12316 ATM1YMR301C 2073 nt8.16□□□□□ -1.1
TY1B-GR3Q12316 PXR1YGR280C 816 nt8.16□□□□□ -1.1
TY1B-GR3Q12316 MLC2YPR188C 492 nt8.15□□□□□ -1.1
TY1B-GR3Q12316 PHO3YBR092C 1404 nt8.15□□□□□ -1.1
TY1B-GR3Q12316 DIT2YDR402C 1470 nt8.15□□□□□ -1.11
TY1B-GR3Q12316 VPS29YHR012W 849 nt8.15□□□□□ -1.11
TY1B-GR3Q12316 UTP7YER082C 1665 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1B-GR3Q12316 PFK2YMR205C 2880 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1B-GR3Q12316 OAC1YKL120W 975 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1B-GR3Q12316 PEP4YPL154C 1218 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1B-GR3Q12316 UBA3YPR066W 900 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1B-GR3Q12316 JEM1YJL073W 1938 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1B-GR3Q12316 YOL036WYOL036W 2286 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1B-GR3Q12316 YDR053WYDR053W 396 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1B-GR3Q12316 FAU1YER183C 636 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1B-GR3Q12316 FET4YMR319C 1659 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1B-GR3Q12316 MID1YNL291C 1647 nt8.12□□□□□ -1.11
TY1B-GR3Q12316 ICS3YJL077C 396 nt8.12□□□□□ -1.11
TY1B-GR3Q12316 GYP1YOR070C 1914 nt8.12□□□□□ -1.11
TY1B-GR3Q12316 ERG4YGL012W 1422 nt8.11□□□□□ -1.11
TY1B-GR3Q12316 ARG8YOL140W 1272 nt8.1□□□□□ -1.11
TY1B-GR3Q12316 MCH4YOL119C 1506 nt8.1□□□□□ -1.11
TY1B-GR3Q12316 SRV2YNL138W 1581 nt8.09□□□□□ -1.11
TY1B-GR3Q12316 YNG2YHR090C 849 nt8.09□□□□□ -1.11
TY1B-GR3Q12316 ILV2YMR108W 2064 nt8.09□□□□□ -1.12
TY1B-GR3Q12316 SEH1YGL100W 1050 nt8.08□□□□□ -1.12
TY1B-GR3Q12316 SNZ3YFL059W 897 nt8.07□□□□□ -1.12
TY1B-GR3Q12316 SNZ2YNL333W 897 nt8.07□□□□□ -1.12
TY1B-GR3Q12316 DCC1YCL016C 1143 nt8.07□□□□□ -1.12
TY1B-GR3Q12316 PRP24YMR268C 1335 nt8.07□□□□□ -1.12
TY1B-GR3Q12316 HSF1YGL073W 2502 nt8.07□□□□□ -1.12
TY1B-GR3Q12316 CCS1YMR038C 750 nt8.07□□□□□ -1.12
TY1B-GR3Q12316 GPT2YKR067W 2232 nt8.06□□□□□ -1.12
TY1B-GR3Q12316 TIF5YPR041W 1218 nt8.06□□□□□ -1.12
TY1B-GR3Q12316 NHP6AYPR052C 282 nt8.06□□□□□ -1.12
TY1B-GR3Q12316 YIL067CYIL067C 2037 nt8.05□□□□□ -1.12
TY1B-GR3Q12316 MTQ2YDR140W 666 nt8.05□□□□□ -1.12
TY1B-GR3Q12316 YOR389WYOR389W 1875 nt8.04□□□□□ -1.12
TY1B-GR3Q12316 ACF2YLR144C 2340 nt8.02□□□□□ -1.13
TY1B-GR3Q12316 LYS2YBR115C 4179 nt8.01□□□□□ -1.13
TY1B-GR3Q12316 YLF2YHL014C 1218 nt8.01□□□□□ -1.13
TY1B-GR3Q12316 ULA1YPL003W 1389 nt8.01□□□□□ -1.13
TY1B-GR3Q12316 MRF1YGL143C 1242 nt8□□□□□ -1.13
TY1B-GR3Q12316 CKB2YOR039W 777 nt8□□□□□ -1.13
TY1B-GR3Q12316 YEH2YLR020C 1617 nt7.99□□□□□ -1.13
TY1B-GR3Q12316 HRP1YOL123W 1605 nt7.99□□□□□ -1.13
TY1B-GR3Q12316 SAF1YBR280C 1914 nt7.99□□□□□ -1.13
TY1B-GR3Q12316 RPN7YPR108W 1290 nt7.99□□□□□ -1.13
TY1B-GR3Q12316 RPT4YOR259C 1314 nt7.98□□□□□ -1.13
TY1B-GR3Q12316 YPR123CYPR123C 435 nt7.98□□□□□ -1.13
TY1B-GR3Q12316 YRF1-4YLR466W 4149 nt7.98□□□□□ -1.13
TY1B-GR3Q12316 SCS2YER120W 735 nt7.97□□□□□ -1.13
TY1B-GR3Q12316 SCO2YBR024W 906 nt7.97□□□□□ -1.13
TY1B-GR3Q12316 APJ1YNL077W 1587 nt7.97□□□□□ -1.13
TY1B-GR3Q12316 QDR3YBR043C 2070 nt7.97□□□□□ -1.13
TY1B-GR3Q12316 ENT5YDR153C 1236 nt7.97□□□□□ -1.13
TY1B-GR3Q12316 YHR214WYHR214W 612 nt7.97□□□□□ -1.13
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