Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TYRO3Q06418 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TYRO3Q06418 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TYRO3Q06418 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms