Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPN12Q05209 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPN12Q05209 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPN12Q05209 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms