Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCQQ04759 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms