Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT17Q04695 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT17Q04695 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms