Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNC4Q03721 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms