Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CFHR1Q03591 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms