Protein–RNA interactions for Protein: Q02543

RPL18A, 60S ribosomal protein L18a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18AQ02543 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms