Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CYP27A1Q02318 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP27A1Q02318 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms