Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 ALT1YLR089C 1779 nt5.29□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 LSG1YGL099W 1923 nt5.29□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 MAK31YCR020C-A 267 nt5.28□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 ADD37YMR184W 597 nt5.28□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 TIP41YPR040W 1071 nt5.28□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 YPR150WYPR150W 522 nt5.28□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 MRC1YCL061C 3291 nt5.28□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 YBR138CYBR138C 1575 nt5.28□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 VNX1YNL321W 2727 nt5.28□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 LPL1YOR059C 1353 nt5.28□□□□□ -1.56
SKO1Q02100 KEX2YNL238W 2445 nt5.27□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 YDR015CYDR015C 240 nt5.27□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 COX20YDR231C 618 nt5.27□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 RPC19YNL113W 429 nt5.27□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 PRE2YPR103W 864 nt5.27□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 PYC1YGL062W 3537 nt5.27□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 BZZ1YHR114W 1902 nt5.27□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 AMA1YGR225W 1782 nt5.27□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 UBX2YML013W 1755 nt5.27□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 PTK2YJR059W 2457 nt5.26□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 ARH1YDR376W 1482 nt5.26□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 FRE7YOL152W 1863 nt5.26□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 FLC3YGL139W 2409 nt5.26□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 PMT2YAL023C 2280 nt5.26□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 CLB1YGR108W 1416 nt5.26□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 APM1YPL259C 1428 nt5.26□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 YCR006CYCR006C 474 nt5.26□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 YET3YDL072C 612 nt5.26□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 VAM7YGL212W 951 nt5.26□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 PPR1YLR014C 2715 nt5.26□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 WTM1YOR230W 1314 nt5.25□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 VPS4YPR173C 1314 nt5.25□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 RPL12AYEL054C 498 nt5.25□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 ECM14YHR132C 1293 nt5.25□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 DOT5YIL010W 648 nt5.25□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 MRS1YIR021W 1092 nt5.25□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 AST1YBL069W 1290 nt5.25□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 UIP4YPL186C 915 nt5.25□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 FHL1YPR104C 2811 nt5.25□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 RNR3YIL066C 2610 nt5.25□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 VBA1YMR088C 1689 nt5.24□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 PDE1YGL248W 1110 nt5.24□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.24□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 MRS3YJL133W 945 nt5.24□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 YKL107WYKL107W 930 nt5.24□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 YOL079WYOL079W 399 nt5.24□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 MCH1YDL054C 1461 nt5.24□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 LCB2YDR062W 1686 nt5.24□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 ILV1YER086W 1731 nt5.23□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 GPB2YAL056W 2643 nt5.23□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 YGR176WYGR176W 348 nt5.23□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 BUD32YGR262C 786 nt5.23□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 YJR115WYJR115W 510 nt5.23□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 SPC42YKL042W 1092 nt5.23□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 MAC1YMR021C 1254 nt5.23□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 YOL035CYOL035C 303 nt5.23□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 ICL1YER065C 1674 nt5.23□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 WHI4YDL224C 1950 nt5.23□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 HRQ1YDR291W 3234 nt5.23□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 APE1YKL103C 1545 nt5.23□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 YPL245WYPL245W 1365 nt5.22□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 MID2YLR332W 1131 nt5.22□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 OSW5YMR148W 447 nt5.22□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 CAF40YNL288W 1122 nt5.22□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 COA2YPL189C-A 207 nt5.22□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 YCK1YHR135C 1617 nt5.22□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 RPT1YKL145W 1404 nt5.22□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 VPS70YJR126C 2436 nt5.22□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 MNN5YJL186W 1761 nt5.21□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 RET1YOR207C 3450 nt5.21□□□□□ -1.57
SKO1Q02100 SLD2YKL108W 1362 nt5.21□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 KEL1YHR158C 3495 nt5.21□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 SKI6YGR195W 741 nt5.21□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 RPE1YJL121C 717 nt5.21□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 POP5YAL033W 522 nt5.21□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 RPS5YJR123W 678 nt5.21□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.21□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 YDR132CYDR132C 1488 nt5.2□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 SKS1YPL026C 1509 nt5.2□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 PCL6YER059W 1263 nt5.2□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 JNM1YMR294W 1122 nt5.2□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 SNN1YNL086W 309 nt5.2□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 YOR200WYOR200W 399 nt5.2□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 VMA4YOR332W 702 nt5.2□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 SUE1YPR151C 621 nt5.2□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 MRE11YMR224C 2079 nt5.2□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 SIT4YDL047W 936 nt5.19□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 RPN11YFR004W 921 nt5.19□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 SEN34YAR008W 828 nt5.19□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 SRN2YLR119W 642 nt5.19□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.19□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 ENV7YPL236C 1095 nt5.19□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 YMC1YPR058W 924 nt5.19□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt5.19□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 PRT1YOR361C 2292 nt5.19□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 SFB3YHR098C 2790 nt5.19□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 EXG1YLR300W 1347 nt5.19□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 GUD1YDL238C 1470 nt5.19□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 CTS2YDR371W 1536 nt5.18□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 RHO3YIL118W 696 nt5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.6 ms