Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TFAP4Q01664 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TFAP4Q01664 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TFAP4Q01664 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TFAP4Q01664 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TFAP4Q01664 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TFAP4Q01664 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TFAP4Q01664 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TFAP4Q01664 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TFAP4Q01664 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TFAP4Q01664 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TFAP4Q01664 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TFAP4Q01664 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TFAP4Q01664 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TFAP4Q01664 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TFAP4Q01664 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TFAP4Q01664 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TFAP4Q01664 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TFAP4Q01664 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TFAP4Q01664 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TFAP4Q01664 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TFAP4Q01664 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TFAP4Q01664 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TFAP4Q01664 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TFAP4Q01664 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TFAP4Q01664 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TFAP4Q01664 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TFAP4Q01664 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms