Protein–RNA interactions for Protein: Q01415

GALK2, N-acetylgalactosamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALK2Q01415 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GALK2Q01415 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GALK2Q01415 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GALK2Q01415 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GALK2Q01415 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GALK2Q01415 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GALK2Q01415 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GALK2Q01415 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms