Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG7P83436 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG7P83436 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COG7P83436 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG7P83436 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG7P83436 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG7P83436 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG7P83436 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG7P83436 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG7P83436 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG7P83436 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
COG7P83436 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG7P83436 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG7P83436 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
COG7P83436 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG7P83436 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG7P83436 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG7P83436 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG7P83436 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG7P83436 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG7P83436 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG7P83436 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG7P83436 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG7P83436 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG7P83436 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COG7P83436 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG7P83436 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG7P83436 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG7P83436 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG7P83436 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG7P83436 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COG7P83436 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG7P83436 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG7P83436 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG7P83436 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG7P83436 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG7P83436 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
COG7P83436 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG7P83436 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG7P83436 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG7P83436 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG7P83436 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG7P83436 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG7P83436 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG7P83436 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG7P83436 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG7P83436 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG7P83436 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COG7P83436 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG7P83436 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG7P83436 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG7P83436 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG7P83436 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG7P83436 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG7P83436 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG7P83436 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG7P83436 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COG7P83436 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COG7P83436 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG7P83436 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG7P83436 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG7P83436 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG7P83436 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG7P83436 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG7P83436 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG7P83436 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG7P83436 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG7P83436 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG7P83436 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG7P83436 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
COG7P83436 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG7P83436 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG7P83436 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG7P83436 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG7P83436 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG7P83436 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG7P83436 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG7P83436 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG7P83436 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG7P83436 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG7P83436 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG7P83436 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG7P83436 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG7P83436 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG7P83436 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG7P83436 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG7P83436 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG7P83436 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG7P83436 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG7P83436 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG7P83436 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
COG7P83436 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG7P83436 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
COG7P83436 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG7P83436 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
COG7P83436 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG7P83436 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG7P83436 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG7P83436 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG7P83436 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms