Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms