Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTG1P63261 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms