Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRPD1P62314 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms