Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMO4P61968 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMO4P61968 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMO4P61968 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LMO4P61968 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMO4P61968 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMO4P61968 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMO4P61968 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMO4P61968 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMO4P61968 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMO4P61968 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMO4P61968 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMO4P61968 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMO4P61968 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LMO4P61968 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LMO4P61968 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMO4P61968 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMO4P61968 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMO4P61968 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMO4P61968 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMO4P61968 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMO4P61968 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMO4P61968 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMO4P61968 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMO4P61968 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMO4P61968 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMO4P61968 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMO4P61968 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMO4P61968 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMO4P61968 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMO4P61968 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMO4P61968 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMO4P61968 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMO4P61968 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMO4P61968 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMO4P61968 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMO4P61968 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMO4P61968 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMO4P61968 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LMO4P61968 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMO4P61968 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMO4P61968 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMO4P61968 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMO4P61968 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMO4P61968 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMO4P61968 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMO4P61968 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMO4P61968 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LMO4P61968 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMO4P61968 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMO4P61968 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMO4P61968 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMO4P61968 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMO4P61968 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMO4P61968 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMO4P61968 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMO4P61968 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMO4P61968 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMO4P61968 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMO4P61968 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMO4P61968 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO4P61968 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO4P61968 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO4P61968 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO4P61968 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO4P61968 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO4P61968 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO4P61968 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO4P61968 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO4P61968 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO4P61968 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO4P61968 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO4P61968 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO4P61968 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO4P61968 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO4P61968 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO4P61968 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
LMO4P61968 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMO4P61968 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMO4P61968 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMO4P61968 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMO4P61968 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO4P61968 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO4P61968 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO4P61968 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO4P61968 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO4P61968 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO4P61968 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO4P61968 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO4P61968 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO4P61968 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO4P61968 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO4P61968 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO4P61968 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO4P61968 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO4P61968 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO4P61968 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO4P61968 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO4P61968 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO4P61968 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms