Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVFC1-1P60608 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms