Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ERVFC1P60507 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVFC1P60507 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVFC1P60507 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms