Protein–RNA interactions for Protein: P60411

KRTAP10-9, Keratin-associated protein 10-9, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP10-9P60411 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRTAP10-9P60411 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRTAP10-9P60411 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRTAP10-9P60411 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms